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Grâce au recours à la spectrométrie de masse, couplée à un ensemble de méthodes pré-analytiques et d’outils informatiques dédiés, la protéomique permet d’étudier l’identité, les modifications post-traductionnelles et la dynamique des protéines et complexes multiprotéiques qui sont présents dans une cellule, un tissu, un organisme. La protéomique est arrivée à un degré de maturité tel qu’elle a aujourd’hui la capacité de traiter des demandes de plus en plus complexes, comme des analyses d’études cinétiques ou de cohortes cliniques afin de répondre à des questions de biologie fondamentale ou clinique. Cette évolution nécessite d’être en mesure d’analyser, visualiser et interpréter des quantités massives de données.

ProFI est l’infrastructure nationale en protéomique. Outre les efforts de R&D entrepris, ProFI a pour missions d'offrir aux laboratoires académiques et aux industriels un service de qualité en matière d'analyse protéomique dans le cadre de collaborations ou de services payants, et d'aider à irriguer les nombreuses plateformes françaises de protéomique en partageant les savoir-faire et les outils développés par l'infrastructure.